UIToolbar は基本下詰で配置なのですが、テザリング中とかだとステータス表示に押し出されて下にズレちゃう場合があります。
そういう場合は、Storyboard のAutoLayout でTop Space やBottom Space に0を指定してからAdd Constraints してやればOKです。
具体的には、Toolbar を選択した状態でStoryboard 画面下部にあるPinボタン(左から3番目)を押して、上辺スペースと下辺スペースの値を0のまま、Iの破線をクリックして赤の実線に変更します。
ちなみに、AutoLayout で縦の位置決めを設定すると、幅やら横の位置決めやらも設定してやらないと警告がバラバラと出るのでご注意を。
(Width にチェックONして、左辺か右辺のI破線を赤色実線にすればOKです。)
参考
こちらの記事を参考にさせて頂きました。